2006年，为配合NDS版（钻石、珍珠版）的上市，TV动画同步推出全新系列《神奇宝贝钻石&珍珠》（Pokémon Diamond & Pearl，简称DP）。对战开拓区篇结束后，小遥为了独自挑战城都地区的华丽大赛和小智告别，小胜回到了橙华道馆，小刚也回家去了。小智则受到了小茂的激励，独自带着皮卡丘和偷渡的长尾怪手前往神奥地区挑战联盟。　　新登场的女主角小光，其蓝本取自电玩NDS...

　　美美等人消灭恶梦军团后，回归往日和平日子。某日，于美美面前出现一位少年，他交给美美一封神秘的信。“我们于玫瑰疗园恭候光临……”写信者“芙罗拉”留下这段不可思议的讯息后消失，然后信件就变成了玫瑰契约（Rosepad）。突然间新敌人出现！送信少年此时变成了巨大燕子，带美美脱离险境。可可及果果了解到新危机的降临，于是前往美美的世界，给她们新的变身工具光之手机，变身成新的光之美少女。为解开玫瑰疗园之谜...

　　某日，梦原希在学校图书馆找到一本名叫魔法心愿PDA（Dream Collet）的书，并遇见来自帕鲁米埃王国的可可。可可是为了恢复被恶梦军团破坏的王国而寻找魔法心愿PDA。要使用魔法心愿PDA许愿，必须收集55个光之精灵。美美为了完成可可的心愿，跟其他4名同伴一起变身成光之美少女（プリキュア，Pretty Cure）跟阻碍帕鲁米埃王国复原的恶梦军团战斗。...